Конечно же использовать один рефконтейнер для перевозки различных грузов можно. Только учтите, что это скорей всего повлияет на качество груза, если условия перевозки не соответствуют требованиям каждого груза. Например, если вы перевозите замороженные продукты и свежие фрукты в одном рефконтейнере, замороженные продукты могут разморозиться, а свежие фрукты могут испортиться из-за повышенной температуры. Такое мне кажется вам точно не надо. Так что смотрите у данной компании рефрижераторные контейнеры
http://ref-konteyner.ru/ и покупайте его себе под каждый груз. Сделать это точно получится и компания очень профессиональная. помогут подобрать нужный и с доставкой быстро вам его сами привезут.